Hemmalaget PaiHa kunde ta ledningen sent i den första halvleken när Ermal Brahimi satte matchens första mål.
PaiHa utökade sedan sin ledning i den 80:e minuten genom Veeti Laine.
Rezgar Amani reducerade för FC Åland på övertid men närmare än så kom inte ålänningarna.
FC Åland ligger tvåa i tabellen med tolv poäng upp till Pallo Iirot. Nästa helg väntar en ny bortamatch för FC Åland, då står serietrean FC Inter 2 för motståndet.