Skärgårdsnämnden är inte ett kommunalt organ som skall diskutera gemensamma kommunala frågor, utan nämnden är landskapsregeringens rådgivande organ i skärgårdsfrågor. Det har slagits tydligare fast i en ändring av skärgårdsnämndens reglemente. Samtidigt klargörs också att det i förta hand är tre ministrar som ansvarar för skärgårdsfrågorna, finansministern, näringsministern och trafikministern.